കേസ് അന്വേഷണം കൃത്യമായ രീതിയില് നടന്നില്ലെന്ന് പ്രത്യേക അന്വേഷണം സംഘം കണ്ടെത്തിയിരുന്നു. കേസുമായി ബന്ധപ്പെട്ട് അന്വേഷണം സംഘം ഹാജരാക്കിയ 6,000 പേജുള്ള കുറ്റപത്രത്തിൽനിന്ന് ആര്യൻ ഖാൻ ഉൾപ്പെടെ ആറുപേരെ എൻസിബി ഒഴിവാക്കിയിരുന്നു. ഇതേ തുടര്ന്നാണ് പ്രത്യേക അന്വേഷണ സംഘം ആര്യന് ഖാന് ക്ലീന് ചിറ്റ് നല്കിയത്.